Doom II RPG je pokračování Doom RPG, nastavit jeden rok po první hře (je tam jeden odkaz Dr. Guerard v souboru, ze dne 2146). I když tam není mnoho známo o monster invaze v UAC základny na Marsu, další monster invaze se stalo na Zemi je měsíc. Tým vojáků doprovázených vědec se pustily do základů UAC na Měsíci vyšetřovat. (Podle součástí digitálního komiksu přítomných v iPhone verzi hry, vědec nebyl plánovaný člen expedice,, spíše jeho loď byla vynucena Marines, aby bylo rychle dosaženo Měsíc Tohle není potvrzeno v Děj hry samotné, ačkoli.)
Na začátku skupina rozděluje a hráč je na jeho / její vlastní. Přehrávač je informoval o UAC zaměstnancem jménem Caldex, který informuje tým o invazi a poskytuje rady, jak postupovat. Okamžitě si všiml, jsou konflikty mezi UAC počítače určeného SAL a další neznámé osoby, určené VIOS. SAL (jehož jméno je hra na HAL 9000 z 2001: Vesmírná Odyssea) je AI vyvinula UAC pro pomoc při day-to-day operace v rámci UAC výzkumných zařízení. VIOS (jehož jméno znamená virtuální Ikona hříchu) je zlovolná bytost z pekla, který je napadne UAC v počítačových sítí. Motivy VIOS "jsou nejasné, ale SAL vás upozorní, že ji nebudou věřit nebo pomáhat ji v žádném případě.
Konflikty s VIOS se často objevují ve hře (začínající s mapou 2, a také se vyskytovat v mapách 4, 5 a 7). Na každém setkání se VIOS požádat hráče, aby se rozhodnutí - malloc nebo DELETE. Malloc bude přidělovat "zdroje" na VIOS, čímž pomáhá to; DELETE vymaže tyto "zdroje", hněvat VIOS a vyžadovat, aby hráč dělat boj s VIOS. Zda hráč rozhodne pomáhat VIOS nebo ne určuje, zda (a jak často), hráč musí bojovat VIOS. Výběrem malloc, vyhnete okamžitý bitvu s VIOS; Nicméně, VIOS bude silnější, když tváří v tvář na konci hry, konfrontaci, která je nevyhnutelná. (I když hra nikdy vysvětluje, přesně to, co "zdroje" jsou, to je věřil, že jsou lidské duše, které VIOS může uživit pryč. [ pochvalná zmínka potřebovala ]), Volba malloc vyhnout se konfliktu v krátkodobém horizontu bude tedy způsobí, že na konci hry bitva bude ještě obtížnější.
Poté, co hráč prochází první tři mapy, které obsahují měsíční základny (pravidelně setkávat Caldex, jeden z nepoužitých postav hráč, nebo jiné NPC), s on / ona bude krátce muset projít jeskyní v pekle, kde on / ona narazí Pinkynator , tvor, který založí Pinkies . Poté, co porazil Pinkinator, portál odhalil která přepravuje přehrávač k UAC základny na Zemi.
Po dosažení UAC základnu na Zemi (skládající se z mapy 4 až 6), s / rychle zjistí, že UAC základna na Zemi je zaplavené démony stejně. Hráč se také seznámil s dr Zanax, vědec, který se zdá, že si chce pomoci usnadnit invazi démonů. Hráč bojuje proti jeho / její cestu přes základnu, a setká se další teleport střeženy Spider duchovní otec . Poté, co porazil Spider Mastermind, Dr. Zanax násilně teleportuje hráče do pekla.
Hell zahrnuje Maps 7 až 9. Hráč bitvy přes jeskyně a lávové jámy pekla, krátce setkání s některou z dalších postav hráč (jejíž totožnost se mění v závislosti na aktuálním výběru hráčova charakteru), který dává hráči BFG. Hráč pokračuje probojovat pekla, kde on / ona se setká s Cyberdemon (v mapě
![8) 8)]()
, a zjistí, VIOS je mozek jiného Ikona Sin . VIOS nakonec konfrontován se Mapa 9. Po VIOS je poražen hra končí zlověstným podepsat, nechat hráč vědět, boj ještě není u konce. Osud zbývajících znaků hráč, Caldex, a Dr. Zanax není výslovně jasně